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了不同的时间线，同时寄生了一乘寺贤，神代勇吾和露莎米奈。
黑暗种子能激发被寄生者的潜能，使之成为天才，原作的一乘寺贤便是如此成为了天才少年，而这个世界的神代勇吾，也正是因为被黑暗种子寄生，才成为了让人称道的天才。
零平常看光子郎和巫师兽敲个代码都觉得像是看天书，他就觉得奇怪，自己怎么样也不像是能当天才程序员的人，为什么当年居然能年纪轻轻就参与伊甸系统的开发。
如此一来，一切就合情合理了，包括露莎米奈一个普通的女职员，也能在被寄生之后一手成立以太基金会。
除却激发潜能的力量，黑暗种子本身还有操纵精神的力量，一乘寺贤被种下黑暗种子，黑化成了暴龙改造者。
虽然这也有他自我性格的因素影响，但一乘寺贤原本是预定的第九位被选召的孩子，对应的徽章是“温柔”，就说明他本质上应该是个性格温柔的好孩子，原本就算如何受刺激，也不可能黑化成暴龙改造者。
这背后就是因为黑暗种子的影响，才导致他的性格大变。
而黑暗四天王时代，钢铁帝国通过解析黑暗种子的资料，结合齿轮兽的病毒齿轮发明出了让无数的数码兽闻之变色的黑色齿轮……
将黑暗种子的效力弱化，但精神控制的力量更强，也能一定程度激发潜力，被黑色齿轮附身的数码兽普遍会比原本强上一些。
精神控制，激发潜能，黑色齿轮和黑暗种子从“产品功能”到“产品性状”都已经将两者有联系明摆着写在了脸上。
但是，黑色齿轮与黑暗种子还是有一个最关键的不同，那就是对于黑暗种子来说，激发潜力以及精神控制实际上都只能算是“副效果”，而并不是最重要的效果。
黑暗种子的真正效果，诚如其名所示，它是“种子”……既然是种子，那自然就是为了用来培育“什么”。
考虑到黑暗种子的来历，本身就是千年兽身体的残片，那么黑暗种子的真正效果就很明确了。
通过激发宿主的潜力，控制宿主的精神，进而从宿主身上吸取力量，一但其完全成长，便能吞噬宿主重塑千年兽的身躯！
而就好像当初恶魔兽通过放出黑色齿轮寄生数码兽，然后等到其成长之后，再将被寄生的数码兽连同黑色齿轮一并回收，由此吸收变强。
简单来说，就是放贷然后收利息，一个并不怎么罕见，但却非常有用的快速变强手段！
千年兽通过在不同时间
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